RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278520.9

CCDC82-201, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC82, Length 2,941 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-201ENST00000278520 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CCDC82-201ENST00000278520 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.51□□□□□ -0.41
CCDC82-201ENST00000278520 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC82-201ENST00000278520 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CCDC82-201ENST00000278520 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.25□□□□□ -0.77
CCDC82-201ENST00000278520 FOXD1Q16676 465 aa9.84□□□□□ -0.83
CCDC82-201ENST00000278520 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.73□□□□□ -0.85
CCDC82-201ENST00000278520 ADRA2BP18089 450 aa9.72□□□□□ -0.85
CCDC82-201ENST00000278520 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CCDC82-201ENST00000278520 KCNA4P22459 653 aa9.25□□□□□ -0.93
CCDC82-201ENST00000278520 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.09□□□□□ -0.95
CCDC82-201ENST00000278520 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.91□□□□□ -0.98
CCDC82-201ENST00000278520 MSH5O43196 834 aa8.87□□□□□ -0.99
CCDC82-201ENST00000278520 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CCDC82-201ENST00000278520 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CCDC82-201ENST00000278520 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CCDC82-201ENST00000278520 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CCDC82-201ENST00000278520 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CCDC82-201ENST00000278520 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC82-201ENST00000278520 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC82-201ENST00000278520 ZBTB22O15209 634 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC82-201ENST00000278520 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCDC82-201ENST00000278520 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC82-201ENST00000278520 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC82-201ENST00000278520 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CCDC82-201ENST00000278520 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.36□□□□□ -1.07
CCDC82-201ENST00000278520 SLC4A2P04920 1241 aa8.3□□□□□ -1.08
CCDC82-201ENST00000278520 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.13□□□□□ -1.11
CCDC82-201ENST00000278520 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CCDC82-201ENST00000278520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.04□□□□□ -1.12
CCDC82-201ENST00000278520 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.132e-7■■■□□ 18.8
CCDC82-201ENST00000278520 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8□□□□□ -1.13
CCDC82-201ENST00000278520 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CCDC82-201ENST00000278520 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CCDC82-201ENST00000278520 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CCDC82-201ENST00000278520 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CCDC82-201ENST00000278520 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CCDC82-201ENST00000278520 FKBP8Q14318 412 aa7.81□□□□□ -1.16
CCDC82-201ENST00000278520 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CCDC82-201ENST00000278520 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CCDC82-201ENST00000278520 POTEDQ86YR6 584 aa7.69□□□□□ -1.18
CCDC82-201ENST00000278520 RNF39Q9H2S5 420 aa7.69□□□□□ -1.18
CCDC82-201ENST00000278520 APLP2Q06481 763 aa7.65□□□□□ -1.18
CCDC82-201ENST00000278520 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CCDC82-201ENST00000278520 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CCDC82-201ENST00000278520 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CCDC82-201ENST00000278520 CAPN15O75808 1086 aa7.59□□□□□ -1.19
CCDC82-201ENST00000278520 POLA2Q14181 598 aa7.59□□□□□ -1.19
CCDC82-201ENST00000278520 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CCDC82-201ENST00000278520 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCDC82-201ENST00000278520 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC82-201ENST00000278520 ABCB7O75027 752 aa7.51□□□□□ -1.21
CCDC82-201ENST00000278520 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC82-201ENST00000278520 FBLN2P98095 1184 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC82-201ENST00000278520 PROM2Q8N271 834 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC82-201ENST00000278520 DSG3P32926 999 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC82-201ENST00000278520 FBXO3Q9UK99 471 aa7.37□□□□□ -1.23
CCDC82-201ENST00000278520 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCDC82-201ENST00000278520 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCDC82-201ENST00000278520 OSCARQ8IYS5 282 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC82-201ENST00000278520 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC82-201ENST00000278520 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCDC82-201ENST00000278520 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCDC82-201ENST00000278520 SLC24A1O60721 1099 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC82-201ENST00000278520 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC82-201ENST00000278520 SPDYE6P0CI01 402 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC82-201ENST00000278520 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC82-201ENST00000278520 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC82-201ENST00000278520 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.25
CCDC82-201ENST00000278520 PKD2Q13563 968 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC82-201ENST00000278520 KLHL34Q8N239 644 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC82-201ENST00000278520 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC82-201ENST00000278520 MIER1Q8N108 512 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC82-201ENST00000278520 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC82-201ENST00000278520 SPOCK2Q92563 424 aa7.08□□□□□ -1.28
CCDC82-201ENST00000278520 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.06□□□□□ -1.28
CCDC82-201ENST00000278520 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC82-201ENST00000278520 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC82-201ENST00000278520 PLCB2Q00722 1185 aa7□□□□□ -1.29
CCDC82-201ENST00000278520 RGL2O15211 777 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC82-201ENST00000278520 AKT1S1Q96B36 256 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC82-201ENST00000278520 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC82-201ENST00000278520 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC82-201ENST00000278520 PLEKHG5O94827 1062 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.95□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.93□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 PRR29P0C7W0 189 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 CREBZFQ9NS37 354 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 NUBP1P53384 320 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC82-201ENST00000278520 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CCDC82-201ENST00000278520 NACADO15069 1562 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC82-201ENST00000278520 PITPNM1O00562 1244 aa6.88□□□□□ -1.31
CCDC82-201ENST00000278520 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCDC82-201ENST00000278520 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms