Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SERP1Q9Y6X1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SERP1Q9Y6X1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms