Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms