Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNQ9UQP3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms