Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNND2Q9UQB3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNND2Q9UQB3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNND2Q9UQB3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTNND2Q9UQB3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CTNND2Q9UQB3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTNND2Q9UQB3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNND2Q9UQB3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms