Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHA4Q9UN74 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHA4Q9UN74 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms