Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNRGQ9UMZ2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNRGQ9UMZ2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms