Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPUSD1Q9UJJ7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPUSD1Q9UJJ7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPUSD1Q9UJJ7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPUSD1Q9UJJ7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPUSD1Q9UJJ7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPUSD1Q9UJJ7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPUSD1Q9UJJ7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPUSD1Q9UJJ7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms