Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms