Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSFQ9UBX1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms