Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
EHD3Q9NZN3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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