Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53CQ9NYF3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms