Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMBRD1Q9NUN5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms