Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP7BPQ9NSQ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms