Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOPORSQ9NS56 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOPORSQ9NS56 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms