Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERINC1Q9NRX5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms