Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms