Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN4Q9NQC3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms