Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-5Q9HDB9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-5Q9HDB9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms