Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4AQ9HCS5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB41L4AQ9HCS5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms