Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBX8Q9HC52 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBX8Q9HC52 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms