Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCSER1Q9C0I3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms