Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL4Q9C0H6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL4Q9C0H6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms