Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROPN1BQ9BZX4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROPN1BQ9BZX4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms