Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP58Q9BVL2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms