Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF3Q9BU61 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms