Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TINF2Q9BSI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TINF2Q9BSI4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms