Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM29Q9BSF4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms