Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf88Q9BSF0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf88Q9BSF0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms