Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CMSS1Q9BQ75 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms