Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CITED1Q99966 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CITED1Q99966 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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CITED1Q99966 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CITED1Q99966 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CITED1Q99966 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CITED1Q99966 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CITED1Q99966 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CITED1Q99966 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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