Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP8Q99708 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms