Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms