Protein–RNA interactions for Protein: Q96J01

THOC3, THO complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOC3Q96J01 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
THOC3Q96J01 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
THOC3Q96J01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms