Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms