Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRP36Q96EU6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP36Q96EU6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms