Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFHD2Q96C19 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms