Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPTQ96BT3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms