Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF428Q96B54 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF428Q96B54 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms