Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRIM63Q969Q1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRIM63Q969Q1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TRIM63Q969Q1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TRIM63Q969Q1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TRIM63Q969Q1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRIM63Q969Q1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRIM63Q969Q1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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