Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRAT1Q92837 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRAT1Q92837 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms