Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARPC1AQ92747 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms