Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA4Q8WW22 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DNAJA4Q8WW22 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms