Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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C15orf40Q8WUR7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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C15orf40Q8WUR7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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C15orf40Q8WUR7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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C15orf40Q8WUR7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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C15orf40Q8WUR7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C15orf40Q8WUR7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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C15orf40Q8WUR7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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C15orf40Q8WUR7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C15orf40Q8WUR7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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