Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACBD4Q8NC06 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACBD4Q8NC06 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms