Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NHLRC2Q8NBF2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms