Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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