Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME8Q8N427 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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