Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX29P2Q8IUI4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX29P2Q8IUI4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms