Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALYREFQ86V81 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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